Die meisten DC/DC Wandler haben eine so ähnliche Restwelligkeit... Du kannst eventuell 12/6 V wandeln und dann einen "very low drop down" (0,5 - 1V) Linearregler nachschalten, die Verlustleistung ist da dann minimal

BTW: Bist du sicher, dass du mit dem DC/DC Wandler wirklich eine galvanische Entkopplung erreichst?