ich bastel ja gerade etwas sehr ähnliches (RGB-led mit RC5 und den 3 hardware PWMs), deshalb kann ich dir evtl helfen.

initialisierung der 3 PWMs:
Code:
  // set timers on PB1,2,3 used for PWM output (R,G,B)
  TCCR1A=(1<<COM1A1)|(1<<COM1B1)|(1<<WGM10);
  TCCR1B=(1<<CS10);
  TCCR2=(1<<WGM20)|(1<<COM21)|(1<<CS20);
  
  // initial PWM vals <-- hier die PWM werte zwischen 0 und 255 rein
  OCR1A=0;
  OCR1B=0;
  OCR2=0;
gruesse