ich möchte 2 ATmega miteinander kommunizieren lassen, also so, dass der eine dem anderen ein Byte schicken kann, und der andere vielleicht ein Acknowledge zurücksendet. Aber über was macht man das am besten?
Für die beste Lösung muss man berücksichtigen wieviele Bytes du wie oft und wie schnell über welche Entfernung übertragen willst usw.

Wenn du da nicht selber etwas neues erfinden willst, bietet es sich an auf dafür vorgesehenen Bus-Systeme und Übertragungsprotokolle wie RS232, RS485, SPI, I2C usw. zurückzugreifen.
Wenn du dich danach umsiehst, wirst du da ne Menge Infos zu finden.

Eine recht einfache Lösung wäre z.B. die RX u. TX Pins der beiden Controller zu verbinden. Dann kanst du z.B. in Bascom deine Daten einfach mit "Print" senden und mit "Input", "Inkey" und anderen dafür vorgesehenen Befehlen abfragen.