Auf jeden Fall, sowohl vor und hinter den Regler je einer als auch direkt am uC die vorgeschriebene Anzahl - idR einmal 100nF pro Vdd/Vss-Paar. Ein Elko pro Platine kann auch nicht schaden, aber das ist alles recht oberflächlich, es gibt durchaus auch ICs, die ihre Nenndaten nur einhalten, wenn sie mit einer exakten geometrischen Anordnung verschiedenster C's abgeblockt werden. Ein AVR o.ä. ist da nicht ganz so empfindlich, aber einen 100n dankt er mit Funktion.