@ triti
Wenn es Nadelimpulse sind dann weisst du auch wie breit sie sind, damit hast du die Frequenz. Wenn du C mit 100n annimmst musst du dir nur noch L ausrechnen. Dann suchst du dir die nächstpassende Funkentstördrossel die auch den Strom aushält aus. Vor und nach der Drossel einen 100n Kondensator und es passt. Geht alles ohne höhere Mathematik.
Elkos sind nicht geeignet um Peaks auszufiltern. Wie wäre es mit der Schaltung des Netzteils, dann könnte man vieleicht noch Tips geben.

@Jörn Arne
Wie sieht deine Netzteilschaltung aus, in deiner Controllerschaltung fehlen jegliche Abblockkondensatoren.