@Skynet

IMHO sind die 100nF um die Einbrüche der Versorgungsspannung zu glätten. Der µC schaltet bei 20Mhz 20 * 10^6-mal in der Sekunde. Jedes mal bricht die Versorgungsspannung durch den ohmschen und induktiven Widerstand ein und erholt sich dann wieder. Ist natürlich nicht so toll, die Anschlussleitungen wirken dabei auch als Antenne. Der 100nF soll für jedes schalten kurzzeitig die Ladung liefern, die der µC braucht. Mehr nicht.

An die Ausgänge würde ich keinen Kondensator hängen. Du hast dann im Umschaltmoment den vollen Kurzschlusstrom. Außerdem dauert es länger, bis der Pegel stabil ist. Also nur Nachteile, keine Vorteile.

Bei einem als Eingang geschalteten Pin sieht das Anders aus. 100nF könnten Spannungsspitzen schon abschwächen. Außerdem erreicht man damit eine Tiefpasscharakteristik/Hysterise. Das ist oft erwünscht.