Nimm Treiber für die LEDs, am besten einen ULN2803, hat ein gutes Pinout, dh die Platine ist einfach und du kannst da hunderte von mA reinstecken. Ausserdem ist es einfach kompakter als jede LED mit einem Transistor+2 Widerstände auszustatten.
Vorwiderstände nicht vergessen.
Die Treiber sind wichtig, um die Pins des Controllers nicht zu überlasten. Die können zwar 20mA liefern, aber achte auch auf die Gesamtverlustleistung. Meist kannst du 20mA pro Pin, aber nicht mehr als insgesamt 150mA ziehen.
Wenn du es wirklich klein haben willst/musst, dann nimm besser ein Zusatzic, dass dir dann ne Menge Treiber spart (MAX7219). Wenn du da dann jede LED einzeln Dimmen willst, schickst du die eben so oft an/aus Befehle bis die Helligkeit erreicht wird. Bei dem MAX musst du probieren, da die LEDs eh schon gemultiplext sind, also immer nur 8 LEDs gleichzeitig an sind.