Lass dich von den LEDs nicht verwirren, das RN-Control hat einen Mega32 drauf, und die I2C-Pins sind auf PortC.0 und 1. Deshalb blinken die, wenn dort was übertragen wird.
Du kannst ja die ersten zwei Dipschalter umlegen, dann sieht man es nicht mehr blinken

Zu den Interrupts, die stören hier nur, wenn Du in der ISR einen LCD-Befehl verwendest.

Du kannst ja noch etwas mehr zu Deinem Aufbau erzählen, so kommt man nicht recht weiter.