Von einstellen (ausser der Richtung) weiss ich nix, aber es sollten halt schöne Flanken sein, und nicht zu schnell, weiss jetzt allerdings nicht wie es mit dem timing aussieht, also wann der Timer diese Flanken kennt.

Man kann aber, je nach AVR, den Analog-Comparator zum auslösen einstellen (statt ICP1), hab es aber jetzt nicht so ganz fertig gelesen.

Welche Frequenz wolltest du messen ?