Hi!
Ich kann mich da nur PICture anschließen. Wenn dein Signal wirklich nur ein paar µV groß ist, dann musst du wohl zuerst mit einem Operationsverstärker hin und das ganze um den Faktor 100 Verstärken.
Kommt jetzt natürlich drauf an, was du unter Kompakt verstehst...wenn du nen OP verwenden musst/willst, dann musst du eben ein IC, ein paar Widerstände und Kondensatoren mehr verbauen. Wenn du das ganze in SMD machen kannst, ist das auch nicht wirklich riesig.
Das einzige Problem bei diesen kleinen Spannungen ist, das du für den OP und ggf. den Komparator eine negative Versorgungsspannung benötigst. Das kannst du aber mit einem ICL7660 recht elegant und einfach lösen.

MfG