Hab mir dein .sch mal runtergeladen. Da wirst du mit dem Adler aber nicht viel Freude haben (2 Errors, 117 Warnungen). Benutzt du den ERC nicht? Beseitige erst mal die Fehler im Eagle, dann schauen wir rüber, ob alles paletti ist.
Beim Arbeiten immer .brd UND .sch laden, sonst geht die Konsistenz verloren und man hat viel Arbeit alles wieder anzugleichen, aber auch dabei hilft der ERC (Electrical Rules Check)