ist das mit Eagle ?
die Bauteile sind aber auf dem Schaltplan, nur nicht aufm Board ?
drück mal beim Board das Icon mit der Lupe mit nem Rechteck drinn, tauchen die dann auf ?
hast du vieleicht unbeabsichtigete Brücken drinn ?
hast du eine ältere Version also ein zwischengespeichertes Ergebniss? so musst schon mal nicht das ganze Board neu layouten .
wie hast du die Verbindungen gemacht, mit "route" oder mit "wire" ?
als das bei mir mal aufgetaucht ist, hab ich neu gezeichnet , und das mit Fehler ausgedruckt und als Schablone für den neuen Plan benutzt.

gruß