Ich glaube da hast du einen Gedankenfehler, ich habe die Schaltung RNB-FRA1.2. Da ist links oben der Spannungsanschluss, GND, 6 bis 15V und +24V für die Schrittmotoren.
Wenn du auf der 6 bis 15V Klemme 5V anschliesst kann auf den gesamten 5 und 12V Leitungen nur 5V sein.
Wenn du da was umstricken willst musst du den 5V-Regler herausnehmen und an dessen Ausgang deine 5V anschließen. Dann kannst du auf der 6 bis 15V Klemme deine 12V anschließen und auch gleich JP2 setzen.
Das 5 und 12V anschließen so wie du es willst ist einfach nicht vorgesehen bei diesem Board.
Hubert