Hallo,

ein STK200/300 kompatibler ISP-Adapter geht mit dem Studio nicht,
Wie das Atmel-Teil mit dem Studio arbeitet kann ich nicht sagen, denn ich verwende den oben erwähnten, und brenne mit Bascom, PonyProg oder avrdude, je nachdem womit ich programmiert habe und welchen AVR ich verwende.

Der Schaltplan ist der RN-ISP-Adapter, siehe Link oben.
Die LED muss normalerweise vom Brennprogramm gesteuert werden, braucht man nicht wirklich, denn ich weiss wenn ich meine AVR flashe

Zum Online debuggen musst Du dich auch nach JTAG umsehen, damit kann man auch programmieren. Mit den ISP-Adaptern kann man nur programmieren.