Als Vref für ADC0 benutze ich Vcc, in dem Fall 5V.

ADC8 ist der interne Temperatursensor, der mit Vref = 1.1V ausgelesen wird.

Beim Auslesen von ADC8 hatte ich ADC0 im DIDR0 (Digital Input Disable Register) nicht deaktiviert.

Theoretisch wird ja wie du geschrieben hast nur ein Channel über den Multiplexer angewählt.

Im Datenblatt finde ich keinen Hinweis zu meinem Problem... Es werden immer nur Aussagen getroffen, dass z.b. die Genauigkeit nach einer Vref-Umschaltung leidet, und man die ersten Ergebnisse verwerfen soll...

Wie oben geschrieben werde ich meine Spannungsmessung anpassen, und ebenfalls Vref=1.1V für ASC0 benutzen.

Wenn dann immernoch Controller kaputt gehen, liegt der Fehler woanders