das bei USB-RS232 wandlern die CTS, RTS, ... deaktiviert sind, oder auch treibermäßig nicht unterstüzt werden.
Zu irgendwas müssen die Pins ja gut sein, sonst könnte FTDI die ja gleich weglassen. In ihrer Application Note werden die auch verwendet. Dort wird eine RS232-Schnittstelle dargestellt. Diese arbeitet dann mit einem MAX232. CTS und RTS sind jeweils durchgeschleift.

auch habe ich es erlebt das der Baustein das signal selbst generiert, wenn sein puffer voll ist
Genau so brauche ich das. Und so ist es wohl auch vorgesehen. Aber es funktioniert noch nicht.