"alles" muß ja nicht wieder aufgetrennt werden. Nur die betreffenden Leiterbahnen. Am besten vor dem Routen sich genau überlegen wo welche Bauteile liegen sollen. Das Programm ist (leider) nicht geeignet um "mal schnell" einige Layouts von Hand zu routen.
PS: Der Autorouter ist Müll -> besser gar nicht erst verwenden, dauert war wesentlich länger per Hand aber man bekommt auch das was man will