Wenn der Elko jahrelang gelagert wurde, könnte sich die Elektrolyt-Schicht etwas 'verdünnisiert' haben. Dann muß man (bei großen Elkos über 1000µF sowieso) diese Dinger erst mal wieder neu formieren (das kommt von: in Form bringen, nicht von formatieren, ist ja keine Diskette oder Festplatte).
Mit wenigen mA Strombegrenzung die Spannung langsam bis zum Sollwert hochfahren und dabei den Strom gut im Auge behalten. Sinkt der Strom auf einen Leckstrom im µA-Bereich, dann ist die Elektrolytschicht wieder ok. Macht man das nicht, hast' ja geseh'n.
Vielleicht hast Du den Elko aber auch nur falsch rum angeschlossen ?