... ist Dir klar, daß Du das Multiplexen mußt, brauchst also nur 1 x 3 x 9 Transistoren für RGB und 1 x 9 für die einzelnen 9 Stränge .... das sind imemrhin 36 Ausgänge vom ATmega belegt
Oder Du machst das Ganze über Schieberegister ... wenn die dann auch noch 20mA pro LED können, bräuchteste keine Transistoren