Ob der LED-Pin überhaupt angesteuert wird, ist von der Software abhängig. Guck mal auf SCK, RESET, MOSI oder MISO, da müsste sich auf jeden Fall was tun. RESET muss beim Proggen auf low gehen, und die anderen sollten nen bisschen flackern. Den Vorwiderstand ruhig etwas größer wählen, damit der ISP nicht überlastet wird, so 1k-2k vielleicht.