Das hängt davon ab, was Du in ADMUX als Referenz (Bit6 und Bit7) ausgewählt hast. Dementsprechend ergibt sich die Beschaltung.
In Deiner vorgesehenen Beschaltung (ARef und AVcc verbunden) machen nur die Modi Sinn, bei denen ARef oder AVcc die Referenzspannung bilden. Dann brauchst Du auch kein weiteres Siebglied.
BTW, die Drossel wird eine erhebliche Verbesserung bringen. Achte auch darauf, dass der Kondensator möglichst dicht an AVcc und dem zentralen Massepunkt angeschlossen ist.
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