Dann musst du die Lücke an der 59. Sekunde abwarten und hier den Bitzähler resetten. Dafür gibts die ja.

Ich würde den DCF-Empfänger an einen Interrupt-Pin anschließen und bei einer steigenden Flanke einen Timer starten. Bei einer fallenden Flanke am Pin wird der Timer dann wieder gestoppt und auf Null gesetzt. Je nach Zählerstand kannst du dann 100 und 200 ms unterscheiden. Störungen kannst du so auch erkennen.

Jan