So ungefähr könnte das gehen.

Die Timervorgabe und Prescale = 256 hängen natürlich von der Frequenz ab.

Code:
$crystal = 8000000
Config Timer1 = Timer, Prescale = 256
Const Timervorgabe = 34286
On Timer1 Timer_irq

Enable Timer1
Enable Interrupts

'Hauptprogramm
Do

If x=y 
Timer1 = Timervorgabe
Start Timer 
Endif

Loop


Timer_irq:
Stop Timer1 
Toggle Led1
   Return