Ich denke das geht nur umständlich über die Systemzeit.
Du kannst beim Sekunden zählen ja gleich die Minuten beachten.

z.B.
Code:
blablabla Code der ISR

Incr Sekunden
If Sekunden = 60 then
Sekunden = 0
Incr Minuten
End If

blabla Code der ISR

Return
Aber ich denke mal du willst rückwärts zählen.
Also...
Minuten = Sekunden / 60
Sekunden = Sekunden - ( Minuten * 60 )
Dazu sollten die Sekunden der ISR aber einen anderen Namen haben als Sekunden. Den Namen musst du in der Formal dem entsprechend auch ändern
Und Bascom kann pro Zeile nur eine Operation. Das musst du dann aufteilen und Hilfvariablen benutzen.

PS: Zuviel zum Thema du hast den Rest schon vorbereitet :P

Benutzt du die Demo von BASCOM? Ich könnte mir vorstellen, das du über die Grenze von 2KB kommst. Die neuste Demo kann angeblich 4KB. Das dürfte für deine Anwendung schon reichen.