Mit echten Fließkommazahlen hat man kaum ein Problem mit der Rundung. Da müßte man schon in den Bereich von Millionen kommen. Ein Porblem kann es aber werden wenn man mit Festkommazahlen rechenet und z.B. nur 8 Bit fürs Nachkomma reserviert.
Das mit dem keine Zeit finden für den ADC verstehe ich nicht so recht. Man ließt den ADC aus und verarbeitet den Wert im Filter bzw. Mittelwertbilder. Man hat also für jeden ADC wert genau einen Schritt beim Mitteln. Das einzige was sich ändert ist die Konstante.
Für die Anwendung mit der Pumpe würde ich mal davon ausgehen, dass man über 1-2 Sekunden mitteln will. Das wäre dann z.B. ein Sampling Rate für den ADC von etwa 1000 / s und dann ein Wert von Anzahl von etwa 1000-2000. Je nach geschmack kann man auch weniger Werte nehmen und dafür langsamer messen.